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基于转录组学鉴定右美托咪定缓解大鼠肢体缺血再灌注肺损伤的关键基因

 

Authors Lu K , Ling M, Rao M, Huang H, Liang S, Wei Y , Bai L, Huang Y , Pan L

Received 8 January 2025

Accepted for publication 10 April 2025

Published 24 April 2025 Volume 2025:18 Pages 5427—5445

DOI http://doi.org/10.2147/JIR.S512536

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Peer reviewer comments 3

Editor who approved publication: Dr Qing Lin

背景:肢体缺血再灌注(LIR)是一种常见的临床病症,常导致急性肺损伤(ALI)。右美托咪定(DEX)是一种高选择性α2-肾上腺素能受体激动剂,可缓解LIR诱导的ALI,但其具体作用机制尚未完全阐明。本研究旨在鉴定大鼠LIR-ALI模型中DEX保护作用相关的关键基因。

方法:将Sprague-Dawley大鼠随机分为五组(n = 3 每组):假手术组(仅暴露股动脉,不进行阻断)、LIR组、LIR+DEX组、LIR+抑制剂组LIR+DEX+抑制剂组。顺利获得夹闭股动脉3 h后再灌注3 h建立LIR模型。在缺血前分别给予DEX(50 μg/kg)或阿替美唑(α2受体抑制剂,250 μg/kg)。顺利获得苏木精-伊红(H&E)染色、肺损伤评分、肺湿/干重比以及酶联免疫吸附试验(ELISA)测定白细胞介素-1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子(TNF-α)、丙二醛(MDA)和超氧化物歧化酶(SOD)活性水平来估肺损伤程度。采用RNA测序技术筛选差异表达基因(DEGs),并进行功能富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建及枢纽基因鉴定。同时建立基因-基因互作(GGI)网络,并顺利获得聚合酶链反应(PCR)和ELISA对关键基因进行验证(n = 6 每组)。

结果:LIR可诱发大鼠严重的肺损伤和炎症反应,而DEX预处理可显著缓解上述变化。RNA测序共鉴定出2302DEGs1、471DEGs2、340DEGs31,407DEGs4。经交集和差集分析后,最终确定255DEX相关DEGs(DEGs-Dex)和290个抑制剂相关DEGs(DEGs-In),其中DEGs-Dex主要富集于Wnt/PI3K-Akt信号通路,而DEGs-In则主要参与甘油酯/丁酸代谢。进一步筛选出9Hub-Dex基因和4Hub-In基因,其中SelpTars1呈显著正相关(cor = 0.55,P < 0.05)。PCRELISA实验验证了6个关键基因(Tars1、Atf4、Ep300、Sphk1、AABR07051376.1和Mmp9)的表达。

结论:本研究鉴定了6个与DEX缓解LIR-ALI相关的关键基因,不仅为阐明其作用机制给予了新见解,也为临床干预给予了潜在治疗靶点。

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